Cell | 染色质激活或抑制状态要求了核小体分离的差异性

2021-12-27 01:11:12 来源:
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丝氨酸形态通过有助于或消除该形态的核糖体可以控制突变组的功能和细胞身份不作为。这些丝氨酸形态中都不存在特定的核糖转译后修饰(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定核糖体情况下具体,并可有助于消除性碱基形态的转变成,负面影响突变的表示。为了在减数分裂时依然保有突变表示程序的连续性,不得不丝氨酸形态的大分子特性也只能在子代细胞中都建立。建立完全相同类标准型丝氨酸情况下的重要不得不因素是核糖PTMs,亦然要不存在于核糖H3和H4的尾巴上。因此,在减数分裂的全过程中都,除了DNA解码,表标准型核小体也只能重建,并其所到子代细胞中都。不太可能,学术研究推断出表标准型的经典核糖(比如解码依赖的核糖)时会在解码锯后迅速重新制造。完全相同的学术研究小组推断出H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂遗传突变。然而,这两个核糖修饰都是与消除性丝氨酸形态具体。那么,表标准型中都的核小体,以及它们携带的核糖PTMs是否都能遗传突变到子代细胞大致相同的突变可容纳上呢?来自纽约大学兰戈恩医学中都心的Danny Reinberg教授课题组在Cell发表学术研究Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该学术研究推断出在DNA解码时,作用于与颇受消除丝氨酸地区的核小体分离出来是完全相同的。颇受消除丝氨酸形态中都的核小感颇受被迁移在子代细胞大致相同的突变地区,而作用于标准型丝氨酸形态中都的核小体的其所则是高能量和随机的。为学术研究核小体的分离出来持续性,学术研究者在候选突变可容纳不可逆的标示核糖H3.1和H3.2,以肠道**小鼠中都核小体在减数分裂时的波动。简单来说,该分析方法通过邻近蛋白质标示技术,为了让CRISPR为特定突变可容纳的H3.1和H3.2带上生物素标示,经ChIP-qPCR检测该生物素标示在转录G1期和S期的丰度,以反应核小体的分离出来持续性。若该底物H3.1和H3.2上的生物素标示在一次减数分裂后减少一半,暗示该核小体被迁移在了两个子代细胞的大致相同突变可容纳上;若该生物素修饰很快绝迹,暗示子代细胞并未遗传突变该突变可容纳的核小体。学术研究者首先检测了在**小鼠中都沉默表示的Hoxc6, Ebf1, Meis2突变的核小体分离出来持续性。这些突变可容纳的核小体生物素水平随减数分裂日益缩减到,这示意颇受消除的突变可容纳的核小感颇受被迁移在子代细胞的大致相同前面。这与其成推断出的H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂遗传突变的现象相印证。那么,作用于标准型丝氨酸地区的核小体又是如何分离出来的呢?学术研究者检测了在**小鼠中都被作用于表示的Ccna2, Nanog和Pou5f1突变,推断出该突变可容纳的生物素标示在减数分裂后深褐色高能量情况下,丰度很低,这示意对于作用于标准型丝氨酸地区来说,表标准型核小体没有准确的其所到子代细胞其所的突变可容纳,而是随机其所的。更有趣的是,在正向**小鼠分化时,Hoxc6突变由消除转为作用于,它的核小体其所模式也由准确的同底物其所改为随机其所。这暗示表标准型核小体的大面积其所,可以反映该丝氨酸地区的活性情况下。总的来说,该学术研究通过CRISPR引导的核糖生物素标示的系统,学术研究了核小体在减数分裂全过程中都的因式分解,并推断出作用于与颇受消除的丝氨酸地区的核小体因式分解的完全相同。值得注意的是,在转录的S期中都,颇受消除的丝氨酸地区的解码要晚于作用于标准型丝氨酸地区。这个间隔时间差异也导致常丝氨酸的解码相对速度大于异丝氨酸。异丝氨酸相较速度慢的解码速度快可能应有了核小体的准确其所,而常丝氨酸中都的PTMs则由其所的亦然调节因子(master regulators)直接识别其所DNA核苷酸,并招募PTMs酶重新建立。早期引自:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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