Nat Biotechnol :尺度解读!科学家成功清楚地绘制出人类肠道的微生态系统目录!

2021-12-13 01:06:13 来源:
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近日,一项刊登在国际刊物Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的研究成果报告里面,来自欧洲分子生态学实验室等单独机构的生态学家们通过研究成果将生命消化道化学物质第三组里面所有据信的病原体遗传物质第三组选集成了一个大型的数据库,从而就能帮助研究成果医护人员了解即使病原体遗传物质和肽之间的相似性,以及其对生命生活品质的不良影响。

病原体遍布人精子外,其能够产生肽质来不良影响EVA消化、生活品质和对疾病的易感性,其如此普遍以至于人体化学物质第三组成员的数量要比人体细胞还要多,还包括病原体、细菌和其它化学物质;为了理解病原体在生命生态学里面所角色的关键反派,生态学家们通常则会在实验室里面复合并对其人才培养,随后在对病原体完成DNA化学合成,然而现阶段很多病原体还无法在实验室的环境污染里面被人才培养猎食。

为了授予这些病原体的相关信息,研究成果医护人员采取了另外一种方法,他们从环境污染里面(比如消化道)收集实质上抽取,随后在对整个抽取里面的DNA完成化学合成,然后利用计算机方法对来自实质上抽取里面的数千种物种的性状遗传物质第三组完成重建,这种方法被称之为惠生态学技术,该技术能作为一种替代方法对单个物种的DNA完成复合和化学合成。

研究成果者Rob Finn坚称,去年还包括我们在内的三个单独开发团队重建了成千上万个消化道化学物质第三组遗传物质第三组,而最大的问题就是这些开发团队所得到的结果是否具有能力也,以及是否能将这些结果选集成为一个极为全面的名册。现阶段研究成果医护人员已经从生命消化道里面超过4600种病原体群落里面选集了20万个遗传物质第三组和1.7亿个肽质序列,这种新型的数据库(并存的生命胃消化道遗传物质第三组集合和并存的胃消化道肽质目录)揭示了EVA消化道的巨大丰富性,并为进一步完成消化道化学物质第三组研究成果开端了道路。

研究成果者绘出出的这个巨大的目录是化学物质第三组研究成果的一个先行者,未来或将能为生态学家们提供极为巨量的海洋资源来研究成果生命消化道丰富性里面每一种病原体所角色的关键反派。这项研究成果表明,超过70%被检测到的病原体从而在实验室里面被成功人才培养过,而其在精子的活性几乎未知,而这类病原体里面最大的小团体就是Comantemales;研究成果者坚称,想到Comantemales如此广泛真是一个惊喜,这就更为重要了我们的确对消化道里面的病原体知之甚少,我希望这个目录能帮助生物化学家和分子生态学家在未来几年弥补这一学问填补。

该数据库/目录收集的所有数据都能在Skype海洋资源Mgnify里面授予,其能帮助生态学家们研究化学物质的遗传物质第三组数据并且与当前的数据库完成对比;随着世界各地研究成果开发团队慢慢发布最初数据库,该目录可能则会缩减到还包括其它EVA部位的化学物质第三组,比如皮肤或口腔内部等部位。先前研究成果者坚称,这一目录的选集未来或为化学物质学家和临床研究成果医护人员提供极为丰富的海洋资源,然而研究成果医护人员可能则会在南美洲、东亚地区和乌干达等代表性不足的区域发现更多最初病原体物种,现阶段研究成果医护人员并不清楚不同人群里面病原体丰富性的差异性和变动情况下。

重构出处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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